Apache 使用自已專用的 php.ini 設定檔，PHP CLI Version 可以另外採用自已專用的 php-cli.ini 設定檔。
PHP CLI Version 使用範例：程式執行時可自行指定要使用的 php-cli.ini 設定 ( php -c C:/PHP/php-cli.ini test.php ; -c <path>|<file> Look for php.ini file in this directory )
或者輸入 php --ini 看看 Loaded Configuration Files 是不是 php-cli.ini ，是的話直接輸入 php test.php 也是與上方的範例的執行結果相同。
註：將 php.ini 複製並重新命名為 php-cli.ini，這個在 CLI Version 模式會自動的找到 php-cli.ini。但若改成其它名稱時就不會 (例如： php_cli.ini )，此時程式在自行指定要使用的 php 設定檔。這種做法也許是是更為安全的作法，如此在 CLI 模式其它使用者，在時用時原則上仍是採用與 Web 相同的設定的 php.ini 設定。有特殊需求時再自行指定特定的 php_cli.ini 設定檔。
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